名古屋大學最早起源于1871年在舊名古屋藩的評定所遺址以及名古屋町奉行所遺址上開設的預備醫(yī)院和預備醫(yī)學校。其后幾經(jīng)變遷，于1920年成立愛知醫(yī)科大學，1931年交歸國管成為名古屋醫(yī)科大學。1939年，在名古屋醫(yī)科大學的基礎上成立了名古屋帝國大學，擁有醫(yī)學部和理工學部。
1942年，理工學部分離為理學部和工學部。1947年，改名為名古屋大學。其后經(jīng)過學校制度改革，舊制名古屋大學、附屬醫(yī)學專門部、第八高等學校、名古屋經(jīng)濟專門學校、岡崎高等師范學校等合并為新制名古屋大學，當時擁有文學部、教育學部、法經(jīng)學部、理學部、醫(yī)學部、工學部的6個學部。1950年 法學部和經(jīng)濟學部分離，1951年設置了農(nóng)學部，名古屋大學的學部增至8個，邁上了綜合大學的發(fā)展之路。
1993年，伴隨著教養(yǎng)部的解體等大規(guī)模教育改革，在新時代需求下設立了信息文化學部，導入了學部4年整體教育(醫(yī)學部醫(yī)學科為6年整體教育)。同時，通過戰(zhàn)后的學校制度改革，1953年起設置了修士課程2年、博士課程3年的新制大學院，文學、教育學、法學、經(jīng)濟學、理學、工學的6個研究科開始發(fā)展。之后，又設置了醫(yī)學和農(nóng)學的研究科，當時的8個學部都分別擁有了進行研究生以上教育的大學院。
隨后，1991年開設了國際開發(fā)研究科、1992年開設了人間信息學研究科、1995年開設了多元數(shù)理科學研究科、1998年開設了國際言語文化研究科、 2001年開設了環(huán)境學研究科、2003年開設了信息科學研究科(并廢止了人間信息學研究科)等不含學部的獨立研究科，促使名古屋大學的大學院研究科共達13所。
此外，學校內還開設了3個附屬研究所、2個全國共同利用設施、16個校內共同教育研究設施等。2004年開始，成為國立大學法人的名古屋大學在新的設置運營機制下邁出了新的一步。
所設學部
文學部：哲學文明論(哲學專攻，西洋古典學專攻，中國哲學專攻，中國文學專攻，印度文化學專攻)歷史學，文化史學(日本史學專攻，東洋史學專攻，西洋史學專攻，美學美術史學專攻，考古學專攻)文學語言學(日本文學專攻，日本語學專攻，語言學專攻，英美文學專攻，法國文學專攻，德國文學專攻，英語學專攻)環(huán)境行動學(社會學專攻，心理學專攻，地理學專攻)
教育學部：生涯教育開發(fā)(教育社會史，教育行政學，社會教育學，技術教育學，職業(yè)教育學)學校教育信息(教育信息學，教育課程計劃，教育方法學，教育經(jīng)營學，學校環(huán)境學)國際社會文化(人類形成學，比較教育學，教育人類學，教育經(jīng)濟學)心理社會行動(心理計量學，教授學習心理學，
法學部：各種法律
經(jīng)濟學部：經(jīng)濟學科
信息文化學部
理學部：數(shù)學學科，物理學科，化學科，生命理學，地球行星科學
醫(yī)學部：保健學科，基礎醫(yī)學科，社會醫(yī)學科，臨床醫(yī)學科
工學部：化學 生物工學科，物理工學科，電氣電子 信息工學科，機械航空工學科，社會環(huán)境工學科
農(nóng)學部：生物環(huán)境科學科，資源生物科學科，應用生命科學科
研究生專業(yè)設置
文學研究科，教育發(fā)展科學研究科，法學研究科，經(jīng)濟學研究科，理學研究科，醫(yī)學研究科，工學研究科，生命農(nóng)學研究科，國際開發(fā)研究科，多元數(shù)理科學研究科，國際語言文化研究科，環(huán)境學研究科，信息科學研究科